• Ex miembro de la Capella Cervantina dirigida por el flautista mexicano Horacio Franco, con quien difundió nacional e internacionalmente la música novohispana, objeto de su investigación.
• De 1990 a la fecha ha transcrito a la notación musical actual más de 500 obras polifónicas de compositores novohispanos, pertenecientes a los archivos de las catedrales de México, Puebla, Oaxaca, del Museo Nacional del Virreinato en Tepotzotlán, Estado de México, del Museo del Carmen en San Ángel, Ciudad de México, y de la Biblioteca Nacional de Madrid, España.
• Desde 1991 a la fecha, ha sido investigador del Centro Nacional de Investigación y Documentación e Información Musical “Carlos Chávez” (CENIDIM), del Instituto Nacional de Bellas Artes.
• Ha editado tres volúmenes de música vocal polifónica de la época virreinal con obras de Francisco López Capillas (1614-1674), primer gran compositor conocido nativo de América y Maestro de Capilla de la Catedral de México, y dos más con obras de Hernando Franco (1532-1585), primer gran Maestro de Capilla de la misma catedral.
• De 1992 a 1996 Juan Manuel Lara Cárdenas también participó en la transcripción del Cancionero Musical de Gaspar Fernández (ca. 1566-1629) del Archivo de la Catedral de Oaxaca, junto con Aurelio Tello en el CENIDIM.
• Desde el año 2001, ha sido miembro fundador y asesor del Seminario Nacional de Música Novohispana y del México Independiente.
• Actualmente trabaja en la edición de los Salmos de vísperas y los Magnificats de Hernando Franco, y las 8 misas de Francisco López Capillas.

Con el Coro Melos Gloriae:

• Fundador y director del Coro Melos Gloriae, especializado en la interpretación del Canto gregoriano y la polyfonía clásica novohispana americana y europea y de música barroca mexicana. Incluyendo música en lenguas indígenas de la época colonial.
• Ha ofrecido conciertos en diferentes foros de la Ciudad de México y de otras entidades de la República mexicana (Estado de México, Tlaxcala, Querétaro, Michoacán, Durango, Coahuila, Guanajuato, Zacatecas, Puebla y Oaxaca.)
• En el año 2007 grabó el disco: Officium Defunctorum Novohispanicum, con música de Hernando Franco y otros autores anónimos.
• En 2012 grabó la misa Benedicta sit Sancta Trinitas, del compositor novohispano Francisco López Capillas.
• Recientemente grabó música polifónica y “canto llano” de los libros corales del acervo musical del Museo Nacional del Virreinato, pertenecientes originalmente a la catedral de México, para sonorizar la exposición de libros de coro presentados en la Sala de Exposiciones Temporales de dicho museo.

Premios y distinciones:

• En 1993 fue propuesto por el Colegio de Investigadores del CENIDIM para el “Premio Nacional de Educación e Investigación Artísticas”.
• En 1996 y 1998 Ganó dos medallas como “Docente destacado SEP” en 1996 y 1998.
• En 2002 el Consejo Nacional para la Cultura y las Artes le otorgó el primer lugar del “Premio al Desempeño Académico en Investigación”.
• En 2004 se hizo acreedor a la Medalla “Maestro Rafael Ramírez”.
• En 2005 obtuvo la Medalla “Ignacio Manuel Altamirano”.
• En el año 2010 el Instituto Nacional de Bellas Artes lo condecoró con el “Premio a la Excelencia Académica”.